38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1360 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1360  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0876  hypothetical protein  56.59 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.423577  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3017  hypothetical protein  32.95 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1575  hypothetical protein  39.84 
 
 		 240 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4736  hypothetical protein  39.5 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.935032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2473  putative transmembrane protein  39.32 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578174  normal  0.940793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5516  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1232  hypothetical protein  32.9 
 
 		 176 aa  88.2  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000655533  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1118  hypothetical protein  39.17 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1598  hypothetical protein  39.17 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1770  putative transmembrane protein  40.2 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1639  hypothetical protein  43.3 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1494  hypothetical protein  38.74 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5890  hypothetical protein  29.28 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2187  hypothetical protein  29.28 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2483  hypothetical protein  41.35 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1514  hypothetical protein  41.24 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1632  putative transmembrane protein  39.78 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4922  hypothetical protein  28.09 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131667  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1601  hypothetical protein  30.63 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5458  hypothetical protein  28.92 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0803  hypothetical protein  41.57 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1214  hypothetical protein  41.57 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0931852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0358  hypothetical protein  41.57 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1701  hypothetical protein  41.57 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1857  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2011  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1842  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 177 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00765  hypothetical protein  23.43 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547305  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0124  hypothetical protein  27.53 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0220  hypothetical protein  24.73 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.231447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2602  hypothetical protein  25.81 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.524516  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08311  hypothetical protein  21.48 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2003  hypothetical protein  23.39 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0038  hypothetical protein  23.77 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00177426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0026  hypothetical protein  28.38 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.859068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4736  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00217507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>