16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1479 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1479  APE2256 family CRISPR-associated protein  100 
 
 		 354 aa  723    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.394423 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3373  hypothetical protein  57.91 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0958  CRISPR-associated APE2256 family protein  40.91 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0745  CRISPR-associated protein APE2256 family  32.23 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1656  CRISPR-associated protein APE2256 family  30.48 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0445  CRISPR-associated APE2256 family protein  32.76 
 
 		 222 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  hitchhiker  0.0045527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15100  putative CRISPR-associated protein, APE2256 family  27.15 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1281  CRISPR-associated protein APE2256 family  28.72 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0224948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1263  CRISPR-associated protein APE2256 family  27.53 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1342  CRISPR-associated protein APE2256 family  25.99 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.330295  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2271  CRISPR-associated protein, APE2256 family  27.88 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.452676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1109  CRISPR-associated protein APE2256 family  28.64 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000998852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5837  CRISPR-associated protein, APE2256 family  24.19 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0258  CRISPR-associated APE2256 family protein  24.53 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1509  CRISPR-associated protein APE2256 family  23.05 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.113599  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2300  hypothetical protein  26.43 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>