14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1463 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1463  NUDIX hydrolase  100 
 
 
189 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00210578  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0317  MutT family phosphoesterase  38.42 
 
 
195 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1401  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
199 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1447  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
199 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00273498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1664  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
195 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2046  hypothetical protein  38.12 
 
 
206 aa  99  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.60672  normal  0.497968 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1641  hypothetical protein  30.05 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1241  MutT/nudix family protein  33.99 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000232725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2194  phosphoesterase (MutT family)-like protein  35.95 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1735  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1769  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00011736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0142  MutT family phosphoesterase  31.82 
 
 
562 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261415  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  30.51 
 
 
325 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
138 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>