29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0839 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  244  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  85 
 
 
120 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  85 
 
 
120 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  83.19 
 
 
120 aa  207  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  29.82 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  29.2 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  32.18 
 
 
124 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  24.55 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 
285 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  25.44 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  28.21 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  25.42 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  25.42 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1472  hypothetical protein  28.45 
 
 
265 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  28.43 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  26.79 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  28.81 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  26.55 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  24.58 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  26.55 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  24.58 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  24.58 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  23.73 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  23.73 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  27.12 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  26.55 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  28.93 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  26.27 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0416797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>