195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0583 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  79.62 
 
 
314 aa  528  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  79.3 
 
 
314 aa  507  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  79.3 
 
 
314 aa  507  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  75.8 
 
 
314 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  75.48 
 
 
314 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  61.2 
 
 
316 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  60.06 
 
 
319 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  59.12 
 
 
319 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  59.68 
 
 
314 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  59.37 
 
 
314 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2470  protein of unknown function DUF403  59.68 
 
 
314 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  58.73 
 
 
314 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  58.73 
 
 
314 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  48.09 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  47.6 
 
 
322 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  48.08 
 
 
313 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  48.4 
 
 
313 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  48.4 
 
 
313 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  48.4 
 
 
313 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  47.44 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  47.44 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  47.44 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  47.44 
 
 
313 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  46.47 
 
 
343 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  46.79 
 
 
313 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  46.47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  46.47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  46.47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  46.47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  46.47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  46.47 
 
 
313 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  45.19 
 
 
345 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  45.37 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  46.15 
 
 
321 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  43.17 
 
 
316 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  43.17 
 
 
316 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  42.22 
 
 
316 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  43.63 
 
 
315 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  43.31 
 
 
315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0520  hypothetical protein  43.49 
 
 
311 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582097  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  43.27 
 
 
313 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  43.45 
 
 
313 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  43.13 
 
 
313 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  40.62 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  41.35 
 
 
313 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  41.9 
 
 
317 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  42.63 
 
 
319 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  42.19 
 
 
319 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  41.08 
 
 
316 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  41.35 
 
 
313 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  42.28 
 
 
324 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  40.32 
 
 
316 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  42.37 
 
 
322 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0007  hypothetical protein  41.53 
 
 
314 aa  235  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.441698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  42.37 
 
 
322 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  41.59 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3575  hypothetical protein  40.69 
 
 
318 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  41.25 
 
 
320 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  40.62 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  42.15 
 
 
320 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  42.77 
 
 
319 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  40.31 
 
 
319 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42150  hypothetical protein  41.19 
 
 
317 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  41.36 
 
 
322 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  40.95 
 
 
317 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  39.81 
 
 
316 aa  228  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  39.49 
 
 
316 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  38.49 
 
 
316 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  40.81 
 
 
319 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  37.85 
 
 
316 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  39.5 
 
 
318 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  37.85 
 
 
316 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  37.93 
 
 
316 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  39.12 
 
 
316 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  36.59 
 
 
316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  40.51 
 
 
316 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  40 
 
 
316 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  40.06 
 
 
313 aa  218  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  40.51 
 
 
316 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  38.02 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  38.8 
 
 
321 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  38.8 
 
 
321 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  38.51 
 
 
308 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  37.78 
 
 
318 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  36.94 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  36.16 
 
 
335 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3575  protein of unknown function DUF403  36.42 
 
 
309 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0363  hypothetical protein  36.42 
 
 
309 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  38.14 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  34.59 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  35.22 
 
 
334 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  36.33 
 
 
324 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0539  hypothetical protein  33.87 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  35.65 
 
 
327 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  35.58 
 
 
354 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  35.33 
 
 
331 aa  186  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  34.06 
 
 
356 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  35.62 
 
 
355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  34.69 
 
 
357 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>