22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0379 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4229    87.17 
 
 		 793 bp  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.344496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4227    87.17 
 
 		 793 bp  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0923396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0379    100 
 
 		 780 bp  1546    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6917    89.73 
 
 		 601 bp  541  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4165    83.03 
 
 		 841 bp  468  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2792    90.94 
 
 		 375 bp  424  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  90.64 
 
 		 366 bp  416  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  90.64 
 
 		 366 bp  416  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  90.35 
 
 		 366 bp  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  87.02 
 
 		 456 bp  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  87.02 
 
 		 456 bp  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  87.02 
 
 		 456 bp  389  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2793    83.66 
 
 		 444 bp  270  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6914    85.05 
 
 		 321 bp  224  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6145  putative IS1648 transposase  85.27 
 
 		 273 bp  168  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0246    84.69 
 
 		 261 bp  161  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0539    92.19 
 
 		 144 bp  87.7  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  97.22 
 
 		 387 bp  63.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0481  putative transposase  87.5 
 
 		 288 bp  56  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988677  normal  0.294669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6645    92.31 
 
 		 144 bp  54  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3940    92.31 
 
 		 228 bp  54  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114444  hitchhiker  0.00715873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 966 bp  48.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>