33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4907 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  592  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  93.62 
 
 
298 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  93.62 
 
 
306 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  77.68 
 
 
311 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  70.21 
 
 
287 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  68.94 
 
 
287 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  39.78 
 
 
288 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  42.35 
 
 
273 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  44.16 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  42.42 
 
 
280 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  37.39 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  36.44 
 
 
296 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  33.88 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  34.55 
 
 
293 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  38.82 
 
 
289 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  36.58 
 
 
286 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  34.17 
 
 
258 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  34.15 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  32.32 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  27.92 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  24.62 
 
 
271 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  28.02 
 
 
258 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  24.62 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  26.35 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  27.9 
 
 
260 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  27.72 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  29.86 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  25.32 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  28.45 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  27.86 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  27.86 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  25.42 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3112  hypothetical protein  24.89 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>