14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1060 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  320  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  59.57 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  57.72 
 
 		 153 aa  173  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  52.45 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  52.11 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  44.06 
 
 		 180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  46.85 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  42.67 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  39.85 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  37.66 
 
 		 190 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46817  predicted protein  28.78 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  34.92 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>