37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3607 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3607  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  762    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6319  Tetratricopeptide TPR_4  75.95 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0081  tetratricopeptide TPR_4  75.53 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4115  hypothetical protein  60.1 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6083  helix-turn-helix, type 11  60.71 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1994  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  60.71 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739767  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5692  hypothetical protein  58 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0543  hypothetical protein  59.52 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.939754  normal  0.330299 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2553  hypothetical protein  60.86 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2014  hypothetical protein  60.95 
 
 		 406 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2341  hypothetical protein  59.52 
 
 		 406 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0354  hypothetical protein  57.52 
 
 		 413 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856052  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2054  hypothetical protein  60.86 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1896  hypothetical protein  60.14 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6465  hypothetical protein  57.62 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3202  hypothetical protein  58.67 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.480784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1331  putative transcriptional regulator, CadC  57.56 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.900244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2027  hypothetical protein  59.43 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5304  hypothetical protein  61.34 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.967801  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1312  hypothetical protein  60.14 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0250798  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2671  hypothetical protein  58.1 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0727774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4057  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  55.05 
 
 		 406 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0992  tetratricopeptide TPR_4  56.59 
 
 		 406 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1282  hypothetical protein  60.34 
 
 		 406 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0406727  normal  0.439874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0024  hypothetical protein  60.05 
 
 		 406 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1376  hypothetical protein  60.48 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3285  hypothetical protein  57.37 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2027  peptidase cysteine peptidase active site  57.37 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3200  TPR repeat-containing protein  58.27 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6460  hypothetical protein  54.31 
 
 		 406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.678731  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3151  tetratricopeptide TPR_4  57.82 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4849  tetratricopeptide TPR_4  57.96 
 
 		 407 aa  292  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2358  hypothetical protein  56.12 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0345  hypothetical protein  58.72 
 
 		 416 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0361  hypothetical protein  58.85 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0254485  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0374  hypothetical protein  58.35 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.67 
 
 		 316 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>