47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3085 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3085  putative acyl-CoA-binding protein  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0446  acyl-coA-binding protein ACBP  70.24 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.330336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0455  acyl-CoA-binding protein  70.24 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628298  normal  0.491613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0773  acyl-CoA-binding protein  71.08 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859936  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3532  acyl-CoA-binding protein  66.27 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1134  acyl-CoA-binding protein  61.9 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3509  acyl-CoA-binding protein  67.47 
 
 		 84 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4041  acyl-CoA-binding protein  63.86 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1231  acyl-CoA-binding protein  61.9 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.162101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0347  acyl-coA-binding protein ACBP  61.9 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0123  acyl-coA-binding protein ACBP  58.33 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000595584  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2078  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230622  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1947  acyl-CoA-binding protein  59.52 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0103  acyl-CoA-binding protein  59.04 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000596303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2484  acyl-coA-binding protein ACBP  58.33 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515409  hitchhiker  0.000620664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5355  Acyl-CoA-binding protein, ACBP  58.33 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2046  acyl-CoA-binding protein  58.33 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2065  acyl-CoA-binding protein  58.33 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6031  acyl-CoA-binding protein  58.33 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2000  acyl-CoA-binding protein  57.14 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.377951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1653  putative acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192969  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2522  acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2466  acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1305  acyl-coA-binding protein ACBP  57.14 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150747  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2085  acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1358  acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1583  acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3227  acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.457766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2611  acyl-CoA-binding protein  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1239  acyl-coA-binding protein ACBP  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451854  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1366  acyl-CoA-binding protein  53.57 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.322711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1394  acyl-CoA-binding protein  56.63 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971038  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1366  acyl-CoA-binding protein  54.76 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1940  acyl-CoA-binding protein AcbP  52.38 
 
 		 89 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0466887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3734  acyl-CoA-binding protein  56.98 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4032  acyl-coA-binding protein ACBP  53.01 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000477077  normal  0.553982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0394  acyl-CoA-binding protein  51.22 
 
 		 88 aa  90.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0342  acyl-CoA-binding protein  58.21 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3254  acyl-CoA-binding protein  48.78 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.264963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31029  predicted protein  45.45 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.12604 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01420  long-chain fatty acid transporter, putative  44.83 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32604  predicted protein  46.43 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000696357  normal  0.053185 
 
 
-
 
NC_006686  CND03160  long-chain fatty acid transporter, putative  43.18 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34529  predicted protein  41.89 
 
 		 394 aa  54.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2596  acyl-CoA-binding protein  34.15 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14734  predicted protein  36.51 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.605369 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05904  Acyl CoA binding protein family (AFU_orthologue; AFUA_2G11060)  30 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.979863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>