17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2400 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  226  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  98.29 
 
 		 117 aa  224  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  95.73 
 
 		 117 aa  175  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  64.1 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  63.55 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  61.11 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  62.71 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  62.61 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  65.79 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  63.06 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  58.62 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  47.79 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  48.25 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  39.36 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  40.48 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  32.26 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0847  hypothetical protein  31.34 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>