14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1628 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1628  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  296  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2100  hypothetical protein  43.62 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2387  hypothetical protein  43.62 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00036703  normal  0.166527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1086  hypothetical protein  44.74 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2700  hypothetical protein  35.71 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2662  hypothetical protein  38.3 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.311473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2727  hypothetical protein  38.95 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1429  hypothetical protein  36.96 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.82123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2418  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38321  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2218  hypothetical protein  34.29 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1717  hypothetical protein  36.36 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2203  hypothetical protein  35.79 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2221  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2728  hypothetical protein  35.06 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>