16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0006 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.467617 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0052  tRNA-Ala  97.22 
 
 		 75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.707391 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    91.67 
 
 		 203 bp  95.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 72 bp  95.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0047  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0010  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0043  tRNA-Ala  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0062  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749311  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0045  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>