15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1540 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1204  hypothetical protein  67.59 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0300444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1614  hypothetical protein  72.64 
 
 		 113 aa  156  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.19093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1565  hypothetical protein  62.62 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0324  hypothetical protein  46.43 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0137  hypothetical protein  51.38 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.536436  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0176  hypothetical protein  47.27 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3598  hypothetical protein  41.51 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0795  hypothetical protein  39.42 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2319  transcription repressor CinR  40.78 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.628193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1771  hypothetical protein  41.98 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0387  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3552  transcription repressor CinR  36.56 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.498012  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0370  hypothetical protein  34.95 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1727  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>