20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1193 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1193  Protein of unknown function DUF460  100 
 
 
669 aa  1335    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0481  hypothetical protein  55.19 
 
 
650 aa  683    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.93354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2320  hypothetical protein  57.74 
 
 
663 aa  724    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2604  hypothetical protein  46.76 
 
 
646 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0547  hypothetical protein  39.15 
 
 
654 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0419873  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0435  hypothetical protein  37.35 
 
 
767 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3698  hypothetical protein  37.18 
 
 
662 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0054  Protein of unknown function DUF460  35.61 
 
 
658 aa  328  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1871  Protein of unknown function DUF460  32.93 
 
 
657 aa  324  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0706  Protein of unknown function DUF460  34.24 
 
 
658 aa  320  7.999999999999999e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474274  normal  0.739297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2183  Protein of unknown function DUF460  36.43 
 
 
658 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2504  Protein of unknown function DUF460  33.14 
 
 
697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.459934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1179  Protein of unknown function DUF460  28.01 
 
 
613 aa  171  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0738  hypothetical protein  32.92 
 
 
662 aa  170  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.00000149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0232  hypothetical protein  29.96 
 
 
602 aa  166  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0690  hypothetical protein  30.09 
 
 
591 aa  160  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.120921 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1976  hypothetical protein  29.74 
 
 
584 aa  147  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2334  hypothetical protein  30.35 
 
 
585 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0927872  hitchhiker  0.00309238 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2104  hypothetical protein  32.2 
 
 
583 aa  137  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0863  hypothetical protein  28.17 
 
 
639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.949823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>