26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0936 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0936  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 506 aa  1033    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.26189  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1825  beta-lactamase domain-containing protein  52.89 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1198  beta-lactamase domain-containing protein  52.31 
 
 		 509 aa  533  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0395  hypothetical protein  49.9 
 
 		 515 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0909  beta-lactamase-like  37.58 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.79696  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1189  vesicle-fusing ATPase  38.19 
 
 		 344 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.405449  normal  0.0544197 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0773  hypothetical protein  36.92 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000921775  hitchhiker  0.000000000779412 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0194  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 528 aa  200  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1225  hypothetical protein  25.35 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.66964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 		 354 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  26.09 
 
 		 354 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.64 
 
 		 352 aa  53.5  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1550  Beta-lactamase-like  36.84 
 
 		 252 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3951  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.84 
 
 		 252 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00829584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  26.46 
 
 		 354 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3973  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1239  beta-lactamase domain protein  36.25 
 
 		 252 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.668505  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1269  beta-lactamase domain-containing protein  36.25 
 
 		 252 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.914297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  35 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4179  beta-lactamase domain-containing protein  36.25 
 
 		 252 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 354 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1373  Beta-lactamase-like  33.68 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2620  beta-lactamase-like  27.46 
 
 		 258 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  25 
 
 		 285 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.36 
 
 		 559 aa  43.5  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>