14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0135 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0135  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  634    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.679297  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  54.75 
 
 		 310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  54.75 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  53.44 
 
 		 309 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0617  hypothetical protein  52.04 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  47.88 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  45.81 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  43.32 
 
 		 311 aa  241  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  32.09 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  34.49 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  31.81 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  31.23 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0877  DNA polymerase, beta-like region  28.68 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0543  DNA polymerase beta subunit  30.09 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>