18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6828 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6828  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  240  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2328  hypothetical protein  46.67 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00898416  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2656  hypothetical protein  57.75 
 
 
87 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.482309 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0155  hypothetical protein  54.29 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123262  hitchhiker  0.0000255316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  53.42 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2354  hypothetical protein  43.68 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.907944 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  43.84 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  47.3 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  45.95 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1722  hypothetical protein  44.59 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  34.74 
 
 
95 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  39.19 
 
 
300 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4277  hypothetical protein  37.78 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1030  hypothetical protein  39.06 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  39.71 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  38.57 
 
 
310 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  38.57 
 
 
289 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07890  hypothetical protein  36.05 
 
 
182 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>