24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5390 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5390  protein of unknown function DUF1508  100 
 
 		 226 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2059  protein of unknown function DUF1508  50.91 
 
 		 509 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2713  protein of unknown function DUF1508  47.62 
 
 		 523 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2960  protein of unknown function DUF1508  51.06 
 
 		 298 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1407  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  51.6  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3815  hypothetical protein  45.65 
 
 		 61 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6482  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.068016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2018  protein of unknown function DUF1508  35.29 
 
 		 111 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1307  hypothetical protein  38.46 
 
 		 62 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.280375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7233  protein of unknown function DUF1508  38.46 
 
 		 61 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458818  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0423  protein of unknown function DUF1508  43.48 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.558642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2647  protein of unknown function DUF1508  53.85 
 
 		 557 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2795  protein of unknown function DUF1508  40.38 
 
 		 61 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0497827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2504  protein of unknown function DUF1508  40.38 
 
 		 61 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2572  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259353  normal  0.786456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0562  protein of unknown function DUF1508  40.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2527  protein of unknown function DUF1508  41.3 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.595982  normal  0.191056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1089  hypothetical protein  34.55 
 
 		 61 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1117  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2168  hypothetical protein  41.3 
 
 		 127 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7854  protein of unknown function DUF1508  39.58 
 
 		 101 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2330  protein of unknown function DUF1508  53.33 
 
 		 64 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3547  protein of unknown function DUF1508  35.59 
 
 		 166 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2678  hypothetical protein  29.51 
 
 		 969 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>