19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3934 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3934    100 
 
 		 509 bp  1009    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5016  hypothetical protein  99.63 
 
 		 345 bp  523  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  90.07 
 
 		 1392 bp  180  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  87.42 
 
 		 252 bp  149  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4242    85.81 
 
 		 306 bp  133  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.0765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6833    86.08 
 
 		 207 bp  123  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1036    88.57 
 
 		 184 bp  105  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4389    85.06 
 
 		 144 bp  69.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.730994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3194  histidine kinase  100 
 
 		 1992 bp  46.1  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 984 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 462 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  96.3 
 
 		 951 bp  46.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>