15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3592 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  48.03 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  46.51 
 
 
146 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3389  hypothetical protein  44.68 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.248941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  41.83 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  46.21 
 
 
130 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  38.35 
 
 
130 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  35.94 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  29.79 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3755  hypothetical protein  29.66 
 
 
226 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  53.85 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4928  hypothetical protein  32.68 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.936975  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3920  hypothetical protein  26.62 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.879955  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  55.26 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0418  hypothetical protein  26.8 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>