29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0172 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  77.64 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  43.19 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  43.62 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  43.62 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  42.42 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  40.69 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  40.52 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  33.21 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  31.76 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  31.8 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  32.95 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  31.56 
 
 		 293 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  31.33 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  30.95 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  30.33 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  29.05 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  31.15 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  30.89 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  29.3 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  29.3 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  29.88 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  26.41 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  25.64 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  27.78 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  27.66 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  33.58 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  31.97 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>