20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2960 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2975  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331956  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2960  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3299  hypothetical protein  82.26 
 
 		 71 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3515  hypothetical protein  74.63 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2390  protein of unknown function DUF343  61.54 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0302108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2832  protein of unknown function DUF343  67.74 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.125265  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1767  protein of unknown function DUF343  50.79 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  46.43 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1058  hypothetical protein  50.91 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.657355  normal  0.784499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  43.4 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  46.43 
 
 		 61 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  44.83 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  41.07 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3029  hypothetical protein  44.23 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  51.92 
 
 		 58 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>