13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3309 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3309  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  695    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1286  glycosyl transferase, group 1  39.46 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1349  hypothetical protein  40.5 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 770 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01305  WalW protein  28.37 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1196  hypothetical protein  28.99 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2250  hypothetical protein  25.41 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.741825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3081  hypothetical protein  26.23 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4831  WalW protein  23.68 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.608303  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6503  WalW protein  23.36 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2057  hypothetical protein  24.84 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1397  hypothetical protein  21.14 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.237722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>