11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3148 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3148  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  630  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2484  hypothetical protein  43.08 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.235294  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0489  hypothetical protein  37.94 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3165  hypothetical protein  39.71 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3384  hypothetical protein  40.74 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.213677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1884  hypothetical protein  38.28 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163127  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4998  hypothetical protein  40.94 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0621  hypothetical protein  35.16 
 
 		 283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.218672  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1979  hypothetical protein  39.09 
 
 		 297 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0715  hypothetical protein  40.28 
 
 		 265 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0409  hypothetical protein  33.11 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>