16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0476 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  90 
 
 		 352 aa  653    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 351 aa  713    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  90.88 
 
 		 351 aa  655    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0543  DNA polymerase beta subunit  76 
 
 		 354 aa  536  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0877  DNA polymerase, beta-like region  52.34 
 
 		 382 aa  408  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  34.19 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  34.1 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  34.29 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  36.96 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  30.66 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0617  hypothetical protein  35.23 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  32 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  32.95 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0135  hypothetical protein  31.23 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.679297  normal  0.183583 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1193  DNA polymerase beta domain protein region  26.54 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0125  hypothetical protein  23.28 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00861839  hitchhiker  0.000869634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>