30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0355 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0355  TfuA domain-containing protein  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00180468 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1564  TfuA domain-containing protein  90.65 
 
 
214 aa  394  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0481  TfuA domain-containing protein  88.79 
 
 
214 aa  390  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0428  TfuA domain-containing protein  68.72 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2070  TfuA-like protein  40.55 
 
 
214 aa  158  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0590  hypothetical protein  43.01 
 
 
213 aa  147  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0804976  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1210  TfuA domain protein core  39.25 
 
 
208 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1332  TfuA domain-containing protein  39.27 
 
 
217 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1402  TfuA domain-containing protein  37.63 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0526  TfuA-like, core  33.85 
 
 
213 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0822  hypothetical protein  37.61 
 
 
219 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1977  TfuA domain-containing protein  37.36 
 
 
216 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0265574  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0918  TfuA domain-containing protein  28 
 
 
411 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124979  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0861  TfuA-like protein  30.43 
 
 
403 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.060609  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3471  TfuA domain-containing protein  33.16 
 
 
451 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2956  TfuA domain protein core  30.66 
 
 
235 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11405  hypothetical protein  27.62 
 
 
497 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000176066  normal  0.617932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3204  TfuA domain protein core  30.19 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.909027  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6311  TfuA domain protein core  28.31 
 
 
464 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0010  hypothetical protein  36.96 
 
 
344 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6107  TfuA domain-containing protein  31.75 
 
 
456 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620154  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6038  TfuA domain protein core  28.91 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345548  normal  0.623723 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7196  TfuA domain protein core  29.86 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.0994766 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0014  hypothetical protein  35.75 
 
 
344 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.175575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2262  TfuA-like  31.72 
 
 
238 aa  92.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  32.26 
 
 
882 aa  91.7  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4529  TfuA domain-containing protein  26.92 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0910  TfuA domain protein core  29.35 
 
 
403 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0906  TfuA domain protein core  28.79 
 
 
402 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.976855  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1989  TfuA domain-containing protein  30.23 
 
 
258 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>