28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0754 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  96.71 
 
 		 213 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  97.18 
 
 		 213 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.77 
 
 		 213 aa  292  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  40.98 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.35 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  38.6 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  36.19 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.02 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  36.73 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.38 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  34.67 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  33 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  30.37 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.97 
 
 		 145 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  56 
 
 		 150 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  31.05 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  54.55 
 
 		 147 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  45.16 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  39.42 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.18 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  36.47 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  35.56 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  34.44 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 		 210 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>