30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0425 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0425  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
120 aa  234  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0105  transcriptional regulator PadR family protein  57.61 
 
 
120 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0443  transcriptional regulator PadR family protein  41.23 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0031  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.154381  hitchhiker  0.000228125 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0104  transcriptional regulator PadR family protein  38.1 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1653  transcriptional regulator PadR family protein  41.49 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.294087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1513  transcriptional regulator PadR family protein  43.33 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661269  hitchhiker  0.0000096713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0274  regulatory protein MarR  40.35 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0024  hypothetical protein  38.14 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.552032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0244  transcriptional regulator  40.21 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0026  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0566  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.562571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1499  HxlR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353252  hitchhiker  0.00266513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1286  transcriptional regulator  37.76 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0942  hypothetical protein  32.43 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1124  transcriptional regulator  31.46 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0128  transcriptional regulator PadR family protein  31.46 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0241  transcriptional regulator  35.79 
 
 
129 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0886  hypothetical protein  31.67 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0197396  hitchhiker  0.002894 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1228  hypothetical protein  34.94 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>