20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0104 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0104  transcriptional regulator PadR family protein  100 
 
 		 119 aa  234  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0105  transcriptional regulator PadR family protein  46.22 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1653  transcriptional regulator PadR family protein  50.43 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.294087  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1499  HxlR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353252  hitchhiker  0.00266513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0031  putative transcriptional regulator  46.24 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.154381  hitchhiker  0.000228125 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0443  transcriptional regulator PadR family protein  40.95 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0425  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0274  regulatory protein MarR  38.3 
 
 		 184 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0024  hypothetical protein  37.63 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.552032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1286  transcriptional regulator  41.05 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0244  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0566  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.562571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1228  hypothetical protein  41.46 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1124  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1513  transcriptional regulator PadR family protein  35.56 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661269  hitchhiker  0.0000096713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0128  transcriptional regulator PadR family protein  33.73 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0942  hypothetical protein  32.93 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0241  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110482  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  31.71 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>