21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0550 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0550  V-type ATP synthase subunit F  100 
 
 		 99 aa  190  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0366  V-type ATP synthase subunit F  83.84 
 
 		 99 aa  166  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.497366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0297  V-type ATP synthase subunit F  96.97 
 
 		 99 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1616  V-type ATP synthase subunit F  94.95 
 
 		 99 aa  159  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141066  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0064  V-type ATP synthase subunit F  65.66 
 
 		 99 aa  135  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1263  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  35.58 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19420  V-type ATP synthase subunit F  32.69 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1610  V-type ATP synthase subunit F  28.16 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1242  V-type ATP synthase subunit F  31.07 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2346  V-type ATP synthase subunit F  25.96 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.218071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1182  V-type ATP synthase subunit F  26.92 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286084  normal  0.347458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1280  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  38.16 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0286  V-type ATP synthase subunit F  28.85 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1221  V-type ATP synthase subunit F  26.92 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00088216  normal  0.205349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2266  V-type ATP synthase subunit F  29.7 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1610  V-type ATP synthase subunit F  31.68 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.441561  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1080  vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  31.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2678  V-type ATP synthase subunit F  25.96 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00920424  normal  0.0521387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1891  V-type ATP synthase subunit F  31.68 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1452  Vacuolar H+transporting two-sector ATPase F subunit  30.84 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2365  V-type ATP synthase subunit F  26.73 
 
 		 111 aa  40.8  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>