25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0244 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0244  transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  257  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0566  ArsR family transcriptional regulator  78.63 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.562571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1653  transcriptional regulator PadR family protein  40.16 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.294087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0024  hypothetical protein  49.5 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.552032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0031  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.154381  hitchhiker  0.000228125 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0026  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1513  transcriptional regulator PadR family protein  49.41 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661269  hitchhiker  0.0000096713 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0104  transcriptional regulator PadR family protein  37.93 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0443  transcriptional regulator PadR family protein  38.94 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0425  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0274  regulatory protein MarR  39.18 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1499  HxlR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353252  hitchhiker  0.00266513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1286  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1124  transcriptional regulator  42.17 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0128  transcriptional regulator PadR family protein  42.17 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.48876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1228  hypothetical protein  43.37 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0105  transcriptional regulator PadR family protein  36.11 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0942  hypothetical protein  33.87 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.526722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1486  regulatory protein, MarR  41.33 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0241  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110482  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0886  hypothetical protein  32.2 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0197396  hitchhiker  0.002894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2189  HxlR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0115  hypothetical protein  35.44 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  34.25 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>