17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2956 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  329  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  53.16 
 
 
170 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  67.29 
 
 
188 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  65.38 
 
 
201 aa  148  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  60.4 
 
 
154 aa  124  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  57.94 
 
 
153 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  59.41 
 
 
197 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  43.48 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.248742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  52.38 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  42.31 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  41 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  40 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  39.64 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  36.54 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  38.83 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  34.18 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3748  hypothetical protein  26.44 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286744  unclonable  0.000000761757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>