19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0961 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  179  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  52.7 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  42.11 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  42.11 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  42.11 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  40.79 
 
 
89 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  39.53 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  40.79 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1562  hypothetical protein  35.63 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  34.52 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3071  hypothetical protein  37.18 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0905739  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  39.47 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2430  hypothetical protein  38.67 
 
 
89 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3337  hypothetical protein  37.33 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  38.67 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  39.34 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2325  hypothetical protein  42.47 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000715446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  37.35 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>