37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0889 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0889  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
171 aa  333  7.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.267574  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2968  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
139 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3665  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.44 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572265  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3283  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.81 
 
 
120 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0233642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3952  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.48 
 
 
120 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1636  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  44.23 
 
 
121 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2285  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.59 
 
 
119 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3448  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.74 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.458831  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  42.38 
 
 
111 aa  104  6e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  42.57 
 
 
111 aa  104  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5154  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.27 
 
 
125 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0843  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.97 
 
 
164 aa  97.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0864644  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1299  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  35.62 
 
 
103 aa  97.4  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.11215  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0792  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  36.25 
 
 
133 aa  89  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2862  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.1 
 
 
118 aa  84.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.3 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0032  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  33.33 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2162  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  29.03 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0134  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  32.43 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4835  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.89 
 
 
122 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1215  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  28.78 
 
 
114 aa  55.1  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0916  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  25 
 
 
121 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.67 
 
 
111 aa  55.1  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1743  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.66 
 
 
114 aa  50.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1608  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.08 
 
 
112 aa  48.1  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.439148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0892  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.27 
 
 
111 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0510919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2342  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  27.21 
 
 
120 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.556255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0868  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.34 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1773  Na(+)/H(+) antiporter subunit C  43.48 
 
 
123 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0402  hypothetical protein  43.48 
 
 
123 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.45 
 
 
114 aa  45.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12070  NADH dehydrogenase I subunit K  25.68 
 
 
110 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000348654  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  21.38 
 
 
114 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.660845  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2211  membrane bound protein complex subunit mbxG  23.02 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.756272  normal  0.135903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2620  putative Na+/H+ antiporter  28.89 
 
 
128 aa  42  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000417  Na(+) H(+) antiporter subunit C  24.49 
 
 
117 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0954  hypothetical protein  25.68 
 
 
115 aa  41.2  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0333861  normal  0.110098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>