22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2583 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  905    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  35.31 
 
 
484 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  34.66 
 
 
485 aa  222  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  32.83 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  32.83 
 
 
501 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  30.13 
 
 
506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  30.13 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  30.22 
 
 
469 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  30.48 
 
 
484 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  28.14 
 
 
510 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  34.32 
 
 
460 aa  180  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  30.19 
 
 
467 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  27.94 
 
 
454 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  28.27 
 
 
493 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  25.71 
 
 
474 aa  133  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  27.37 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  21.52 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  26.92 
 
 
524 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  24.92 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1101  hypothetical protein  23.33 
 
 
688 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  25.28 
 
 
519 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2175  Protein of unknown function DUF439  35.29 
 
 
289 aa  43.5  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.404006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>