13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1285 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1285  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  147  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.378904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0240  zinc finger protein  61.19 
 
 
69 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665758  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0852  hypothetical protein  60.87 
 
 
69 aa  96.7  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1928  hypothetical protein  61.54 
 
 
69 aa  95.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0148  zinc finger protein  59.7 
 
 
71 aa  92  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0785  zinc finger protein  59.7 
 
 
71 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0207  zinc finger protein  61.19 
 
 
71 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.423209  normal  0.336406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1693  zinc finger protein  61.19 
 
 
71 aa  90.5  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1138  zinc finger protein  55.22 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2452  hypothetical protein  47.69 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2453  zinc finger protein  44.93 
 
 
73 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054676  normal  0.411172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2373  hypothetical protein  34.62 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2374  hypothetical protein  38.71 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>