17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0934 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
576 aa  1166    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  46.05 
 
 
579 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  43.19 
 
 
578 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  43.95 
 
 
578 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  40.7 
 
 
580 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  35.66 
 
 
583 aa  359  7e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  32.03 
 
 
618 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  27.91 
 
 
566 aa  157  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  23.35 
 
 
581 aa  97.8  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  24.76 
 
 
536 aa  90.5  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  23.65 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  24.51 
 
 
544 aa  77  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  26.67 
 
 
535 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  24.16 
 
 
533 aa  73.6  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  22.96 
 
 
536 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  23.57 
 
 
538 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  22.15 
 
 
589 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>