15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0617 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0617  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  622  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  66.44 
 
 
308 aa  411  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  59.04 
 
 
310 aa  358  7e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0135  hypothetical protein  52.04 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.679297  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  52.86 
 
 
309 aa  324  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  51.66 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  47.51 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  44.3 
 
 
311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  38.87 
 
 
317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  33.76 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  34.73 
 
 
351 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  35.23 
 
 
351 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0543  DNA polymerase beta subunit  35.59 
 
 
354 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0877  DNA polymerase, beta-like region  27.76 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0125  hypothetical protein  42.42 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00861839  hitchhiker  0.000869634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>