30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0590 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0590  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0804976  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1210  TfuA domain protein core  50 
 
 
208 aa  208  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1332  TfuA domain-containing protein  52.13 
 
 
217 aa  208  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1977  TfuA domain-containing protein  46.92 
 
 
216 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0265574  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0526  TfuA-like, core  42.03 
 
 
213 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1402  TfuA domain-containing protein  45.31 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0428  TfuA domain-containing protein  41.63 
 
 
218 aa  156  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2070  TfuA-like protein  42.99 
 
 
214 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0355  TfuA domain-containing protein  43.01 
 
 
214 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00180468 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0481  TfuA domain-containing protein  43.55 
 
 
214 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1564  TfuA domain-containing protein  43.01 
 
 
214 aa  148  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3471  TfuA domain-containing protein  39.62 
 
 
451 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0822  hypothetical protein  44.34 
 
 
219 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6107  TfuA domain-containing protein  37.14 
 
 
456 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620154  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6311  TfuA domain protein core  40.09 
 
 
464 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11405  hypothetical protein  36.54 
 
 
497 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000176066  normal  0.617932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3204  TfuA domain protein core  35.89 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.909027  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0010  hypothetical protein  38.31 
 
 
344 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0014  hypothetical protein  34.65 
 
 
344 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.175575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2956  TfuA domain protein core  35.41 
 
 
235 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6038  TfuA domain protein core  32.54 
 
 
247 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345548  normal  0.623723 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7196  TfuA domain protein core  34.72 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.0994766 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4529  TfuA domain-containing protein  34.15 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0918  TfuA domain-containing protein  34.58 
 
 
411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124979  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1989  TfuA domain-containing protein  35.78 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0861  TfuA-like protein  33.84 
 
 
403 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.060609  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  34.52 
 
 
882 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2262  TfuA-like  31.4 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0910  TfuA domain protein core  33.66 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0906  TfuA domain protein core  32.43 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.976855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>