22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2643 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2599  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  252  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2643  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  252  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0926652  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06650  hypothetical protein  49.02 
 
 
112 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2907  hypothetical protein  44.44 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1981  hypothetical protein  41.94 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.510264  normal  0.259293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2642  XRE family transcriptional regulator  45.05 
 
 
119 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0039  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2201  hypothetical protein  37.61 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911557  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4340  hypothetical protein  37.61 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316173  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0385  hypothetical protein  58.06 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4582  hypothetical protein  37.74 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.804527  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0581  hypothetical protein  49.28 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5942  hypothetical protein  49.28 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.967814  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0475  hypothetical protein  49.28 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5551  hypothetical protein  32.84 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.074617 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4217  hypothetical protein  31.08 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4275  hypothetical protein  28.95 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4726  hypothetical protein  26.53 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227983  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3446  XRE family transcriptional regulator  27.54 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.256834  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2541  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2736  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11560  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 
70 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>