36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3110 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3110  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.015067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1741  acyl carrier protein  72.15 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.806605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3159  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2623  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2842  hypothetical protein  39.44 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  40 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3176  hypothetical protein  35.71 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2517  acyl carrier protein  37.14 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.975865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  41.82 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  39.34 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  41.82 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0283  acyl carrier protein, ACP  34 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0171  hypothetical protein  32.79 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  41.82 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  41.82 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1927  phosphopantetheine-binding  28.57 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2227  phosphopantetheine-binding  36.51 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 78 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>