16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0563 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0563  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  640    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.411197  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1976  hypothetical protein  57.1 
 
 
310 aa  360  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33772  normal  0.678453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0135  hypothetical protein  53.44 
 
 
311 aa  343  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.679297  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0437  hypothetical protein  52.12 
 
 
308 aa  335  7e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0617  hypothetical protein  52.86 
 
 
298 aa  324  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1924  hypothetical protein  46.01 
 
 
313 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618938  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0052  hypothetical protein  44.84 
 
 
309 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0461  DNA polymerase beta subunit  41.5 
 
 
311 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0361  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 
352 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0476  DNA polymerase beta subunit  36.96 
 
 
351 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.115268  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0543  DNA polymerase beta subunit  35.92 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1443  DNA polymerase beta subunit  36.68 
 
 
351 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2732  hypothetical protein  35.22 
 
 
317 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.701847  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0877  DNA polymerase, beta-like region  29.17 
 
 
382 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0125  hypothetical protein  26.24 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00861839  hitchhiker  0.000869634 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1193  DNA polymerase beta domain protein region  23.38 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>