29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4387 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  63.13 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  63.13 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  61.45 
 
 
183 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  48.9 
 
 
189 aa  168  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  46.93 
 
 
231 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  43.58 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  43.39 
 
 
299 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  44.32 
 
 
366 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  43.09 
 
 
198 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  41.58 
 
 
191 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  42.94 
 
 
272 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  40.56 
 
 
200 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  35.87 
 
 
194 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  40.45 
 
 
198 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  37.02 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  27.56 
 
 
264 aa  68.2  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0491  hypothetical protein  26.4 
 
 
182 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.754962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  27.33 
 
 
270 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  25.33 
 
 
267 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  30.08 
 
 
263 aa  48.5  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1220  hypothetical protein  27.97 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.17937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1090  hypothetical protein  34.09 
 
 
171 aa  44.7  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  28 
 
 
272 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  28 
 
 
311 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  25.9 
 
 
209 aa  42  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1056  hypothetical protein  25.76 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0117919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  25.69 
 
 
286 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>