26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1200 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  74.18 
 
 
183 aa  271  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  34.29 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  37.64 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
176 aa  84.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  34.68 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  34.1 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  32.78 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  32.37 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  31.22 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  31.64 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  33.72 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  27.41 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  30.81 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  27.95 
 
 
793 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  43.24 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  28.07 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.401797 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  41.67 
 
 
144 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3009  hypothetical protein  45 
 
 
241 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  45.57 
 
 
141 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  44.3 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1509  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  37.04 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>