16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1339 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  41.38 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  31.55 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  30.07 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  30.97 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  29.58 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  30.72 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  30.99 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02974  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510739  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  28.96 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  28.21 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  28.47 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  29.63 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0133  hypothetical protein  28.87 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2616  fimbrial assembly  30.11 
 
 
201 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  27.33 
 
 
452 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>