26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1011 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  95.8 
 
 		 120 aa  233  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  85 
 
 		 120 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  29.82 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  24.32 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  29.67 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  23.42 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  29.13 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  27.88 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  28.16 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1472  hypothetical protein  26.61 
 
 		 265 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  26.21 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  25.21 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  24.37 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  25.62 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  25.21 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  24.37 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  23.53 
 
 		 285 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  25.51 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  25.42 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  24.79 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  23.53 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  24.79 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  25.64 
 
 		 119 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>