25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0534 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  285  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  56.6 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  60.47 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  60.98 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  68.42 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  70 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  53.85 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  58.54 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  77.78 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  58.54 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  45.21 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  52.83 
 
 		 230 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  73.08 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  54.76 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  64.52 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  73.08 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  73.08 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  33.66 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  73.08 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  72 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  48.94 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  65.38 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  32.71 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  51.85 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  64 
 
 		 129 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>