28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0180 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
213 aa  427  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.77 
 
 
213 aa  271  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.3 
 
 
213 aa  271  7e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.77 
 
 
213 aa  270  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  45.02 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  39.07 
 
 
212 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.97 
 
 
231 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  40.49 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  36.55 
 
 
214 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.64 
 
 
207 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
197 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  30.89 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.96 
 
 
145 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  30.3 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  56 
 
 
150 aa  91.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  31.09 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  28.5 
 
 
233 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  44.33 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  53.03 
 
 
147 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  29.95 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  32.94 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  40.28 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  32.22 
 
 
158 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.46 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>