12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4333 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4333  putative TraC conjugal transfer protein  100 
 
 		 74 aa  141  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57449  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5002  TraC family protein  71.05 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0649  TraC family protein  55.41 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7063  conjugal transfer protein Dtr system  44.78 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5515  TraC family protein  40.3 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4674  conjugal transfer protein TraC  41.38 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8049  conjugal transfer protein TraC  40.32 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8130  conjugal transfer protein TraC  40.32 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.852257  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9188  conjugal transfer protein Dtr system  41.67 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5051  conjugal transfer protein TraC  42.86 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5394  conjugal transfer protein TraC  42.86 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6102  hypothetical protein  44.44 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>